يقوم مختبر الاحياء المجهرية والسموم بعزل وتشخيص الاحياء المجهرية (بكتريا وفطريات) من عينات التربة، الهواء، الماء، الرسوبيات،الغذاء، الدواء، الاعلاف، النباتات، الحيوانات والسوائل الجسمية لاشخاص مرضى وآخرين اصحاء، باستخدام الطرق القياسية والمعتمدة من قبل:

1- منظمة الصحة العالمية (WHO).

2- منظمة الغذاء والدواء الاميريكية (FDA).

3- وكالة حماية البيئة الاميريكية (EPA).

فضلا عن امكانية المختبر لتنفيذ بعض الفحوصات المتعلقة بالاحياء المجهرية.